Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX1P22670 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX1P22670 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX1P22670 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms