Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms