Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASTP20810 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASTP20810 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASTP20810 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASTP20810 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASTP20810 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASTP20810 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms