Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA5P20719 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms