Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATF1P18846 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATF1P18846 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATF1P18846 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATF1P18846 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATF1P18846 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATF1P18846 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATF1P18846 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATF1P18846 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms