Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELPP16109 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELPP16109 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELPP16109 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELPP16109 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SELPP16109 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SELPP16109 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SELPP16109 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELPP16109 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms