Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms