Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL6A2P12110 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms