Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEFHP12036 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEFHP12036 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEFHP12036 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEFHP12036 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms