Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms