Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms