Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI4P10075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms