Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VTNP04004 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTNP04004 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTNP04004 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTNP04004 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTNP04004 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTNP04004 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms