Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-5P01602 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms