Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms