Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN1O94985 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms