Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DYSFO75923 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DYSFO75923 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DYSFO75923 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms