Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KA4O75676 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms