Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLIN1O60240 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLIN1O60240 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms