Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1O43719 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1O43719 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms