Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARPC5O15511 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms