Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB6O15197 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms