Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms