Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARVCFO00192 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARVCFO00192 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms