Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H7C1C5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C1C5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C1C5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H7C1C5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H7C1C5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H7C1C5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H7C1C5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H7C1C5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C1C5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C1C5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H7C1C5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H7C1C5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H7C1C5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H7C1C5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms