Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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