Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BQV1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BQV1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BQV1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BQV1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BQV1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BQV1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms