Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HNRNPCL3B7ZW38 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HNRNPCL3B7ZW38 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms