Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GGTLC3B5MD39 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GGTLC3B5MD39 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms