Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
STRCP1A6NGW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms