Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms