Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLRN2A0PK11 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms