Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPG1Q9Y678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG1Q9Y678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COPG1Q9Y678 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPG1Q9Y678 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG1Q9Y678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms