Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF1Q9Y4P9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPEF1Q9Y4P9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPEF1Q9Y4P9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF1Q9Y4P9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms