Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P8

WIPI2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI2Q9Y4P8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI2Q9Y4P8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI2Q9Y4P8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WIPI2Q9Y4P8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms