Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF3AQ9Y496 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIF3AQ9Y496 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KIF3AQ9Y496 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KIF3AQ9Y496 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KIF3AQ9Y496 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KIF3AQ9Y496 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIF3AQ9Y496 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIF3AQ9Y496 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms