Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COQ4Q9Y3A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COQ4Q9Y3A0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COQ4Q9Y3A0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COQ4Q9Y3A0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COQ4Q9Y3A0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COQ4Q9Y3A0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms