Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SBNO2Q9Y2G9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SBNO2Q9Y2G9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SBNO2Q9Y2G9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SBNO2Q9Y2G9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO2Q9Y2G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SBNO2Q9Y2G9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SBNO2Q9Y2G9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SBNO2Q9Y2G9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SBNO2Q9Y2G9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms