Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSX2IPQ9Y2D8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSX2IPQ9Y2D8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSX2IPQ9Y2D8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSX2IPQ9Y2D8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSX2IPQ9Y2D8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms