Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHKBQ9Y259 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHKBQ9Y259 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKBQ9Y259 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKBQ9Y259 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms