Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BSNQ9UPA5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSNQ9UPA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BSNQ9UPA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BSNQ9UPA5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BSNQ9UPA5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BSNQ9UPA5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms