Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLA2G4CQ9UP65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLA2G4CQ9UP65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLA2G4CQ9UP65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLA2G4CQ9UP65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLA2G4CQ9UP65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLA2G4CQ9UP65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLA2G4CQ9UP65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLA2G4CQ9UP65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms