Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BARX2Q9UMQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BARX2Q9UMQ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BARX2Q9UMQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BARX2Q9UMQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms