Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB23Q9ULC3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB23Q9ULC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB23Q9ULC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB23Q9ULC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB23Q9ULC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms