Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBE1Q9UJT0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBE1Q9UJT0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBE1Q9UJT0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TUBE1Q9UJT0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TUBE1Q9UJT0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TUBE1Q9UJT0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms