Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL4Q9UJQ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SALL4Q9UJQ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL4Q9UJQ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SALL4Q9UJQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL4Q9UJQ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL4Q9UJQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.5 ms