Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED13Q9UHV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED13Q9UHV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MED13Q9UHV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED13Q9UHV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED13Q9UHV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms