Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP25Q9UHP3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
USP25Q9UHP3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP25Q9UHP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP25Q9UHP3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP25Q9UHP3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP25Q9UHP3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms