Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF1Q9UH73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EBF1Q9UH73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EBF1Q9UH73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF1Q9UH73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF1Q9UH73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms