Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC4Q9UBN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC4Q9UBN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC4Q9UBN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC4Q9UBN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms